Солдаты, прошедшие после службы в Зоне спецподготовку, или сталкеры, подписавшие контракт с армией. Военные сталкеры снабжаются большим количеством дополнительной аппаратуры, они хорошо экипированы и вооружены . Военные сталкеры изучают причины и последствия катастрофы, а также занимаются картографированием Зоны. Могут ходить как поодиночке, так и группами по несколько человек. С обычными сталкерами не общаются - сразу же открывают огонь на поражение.Их база находиться на Кордоне.